Semaine 1
Exploration d’outils
La semaine 1 va introduire les participants à une boîte à outils computationnelle reproductible pour la science des données neuronales, ainsi que des notions de base en apprentissage automatique supervisé et non-supervisé. Des cours pré-enregistrés et des sessions pratiques interactives sont organisées pendant les cinq jours, et permettent au participant de se familiariser avec une gamme d’outils. Chaque participant devra compléter 4 tutoriels obligatoires, ainsi que 3 tutoriels optionnels choisis parmi une liste. À la fin de la semaine 1, les participants devraient être capables de répondre à des questions telles que:
- Qu’est ce que le contrôle de version, et comment puis-je l’utiliser pour améliorer ma manière de travailler?
- Quels sont les standards de données qui peuvent être utilisés avec les données de neuroimagerie, et pourquoi devrais-je les adopter?
- Comment puis je visualiser et définir des caractéristiques des données de neuroimagerie pour l’apprentissage automatique?
- Quels sont les principes de base du l’apprentissage profond, et en quoi cette approche diffère-t-elle des techniques classiques d’apprentissage machine?
De petits livrables sont demandés pour chaque tutoriel, et comptent pour 10% de la note finale.
Voir le programme de la semaine 1
Semaine 2
Définition de projet au CRIUGM - Université de Montréal
La semaine 2 sera essentiellement consacrée à la définition et au pilotage du projet. En tant que participant, vous devrez décider:
- Sur quel sujet général souhaitez-vous travailler? par exemple une comparaison de groupes en IRMf, ou bien un logiciel d’analyse de données MEG.
- Quelles compétences souhaitez vous apprendre en travaillant sur ce projet? par exemple prétraiter des données IRMf, comment utiliser git, etc…
- Sur quelles ressources souhaitez vous travailler? par exemple le jeu de données CORR, la librairie nipyye, la parcellisation de Glasser, etc…
- Quels objectifs souhaitez vous atteindre avec le projet? Par exemple trouver des différences de connectivité entre deux groupes, reproduire une parcellisation cérébrale multimodale, etc.
- Quels seront les livrables du projet? par exemple un nouveau jeu de données publique, une nouvelle feature dans une librairie, etc.
Chaque projet devra être présenté de manière écrite et orale, avec rétroaction, et sera révisé pour la fin de la semaine 2. Ce résumé de projet comptera pour 20% de la note finale.
Semaine 3
Implémentation du projet à l’Université Concordia
Durant la troisième semaine, les participants travailleront sur leur projet. Une journée type ressemblera à:
- Travail sur le projet. L’essentiel du temps est réservé pour travailler.
- Clinique projets. Suivi et retour quotidien de la part de l’équipe d’instructeurs.
- Chaque jour démarre par une présentation ou un tutoriel.
- Collaboration. Une partie du temps est consacrée à s’entre-aider chaque jour.
Semaine 4
Finalisation du projet et communication à Polytechnique Montréal